夏季是菌痢的高發季節，此時，沙門氏菌腸炎、由輪狀病毒引起的腹瀉也到了發病高峰期。由於三者在臨床上均有腹痛、腹瀉、嘔吐等症狀，易混淆診斷。此外，菌痢與沙門氏菌腸炎在抗生素的使用上不盡相同，而輪狀病毒性腹瀉則不需要用抗生素。因此，對三者加以鑒別，於及時治療有重要意義。
菌痢多由食用不潔食物如蔬菜、水果等引起發病，１歲以內幼兒少見，首發症狀為先瀉後吐，同時有腹痛，以左下腹痛為主，腹瀉的特點是便次頻繁，每日大便次數超過十次，甚至更多，但大便量少，大便性狀為粘液或膿血便，裡急後重明顯，大便鏡檢滿視野白細胞，大使培養可查到志賀氏菌。氟哌酸為目前最佳抗痢藥物。
沙門氏菌腸炎多由食用不潔食物如牛奶、蛋類、家禽、內髒等引起發病，１歲以內幼兒多見。首發症狀為先吐後瀉，常有嘔吐，以臍周腹痛為主，每日便次在３～１０次，大便量多，大便性狀為水樣帶粘液，裡急後重不明顯，大便鏡檢白細胞總數多正常，大便培養可找到沙門氏菌，治療藥物選用復方新話明、氯霉素、氨苄青霉素或第三代頭孢菌素。
輪狀病容是６歲以下幼童非細菌性腹瀉的主要病原，以６個月～２歲小兒發病率最高。輪狀病毒性腹瀉首發症狀為嘔吐、咳嗽，腹瀉每日３～１０次，大便為稀便、水樣或蛋花樣。有酸臭味，無粘液及膿血，大便鏡檢、大便培養均陰性，血象不高，病毒檢測可分離出輪狀病毒。如果沒有繼發細菌感染，可不用抗菌藥物。
